El análisis de la información oficial publicada por la UNCA en su web, en el marco de la Ley 5189/14 de Transparencia, reveló que la institución paga exorbitantes sumas de viáticos a funcionarios privilegiados lo cual genera cuantioso daño al presupuesto de más de G. 70.000 millones anuales. El análisis de una sola factura demostró que el Decano de la Facultad de Ciencias Tecnológicas, presentó como rendición de cuenta, G. 600 mil por un alojamiento que cuesta solo G. 90 mil en Encarnación. A ello se suma la superposición horaria de varios funcionarios que perciben salarios por horas cátedras que se superponen y que no podría darse a menos que logren ser omnipresentes y estén enseñando en dos lugares al mismo tiempo, distintas materias. Un gran porcentaje de los docentes, de las siete unidades académicas de la UNCA, desarrollan clases durante un solo semestre, sin embargo, de acuerdo con la planilla de funcionarios, perciben salarios durante los 12 meses del año.